慢直播：生物信息平臺搭建（2021版）
2021年3月29 - 4月3日 ｜ 每晚 20：30 - 22：00 ｜ 線上直播
課程簡介
互動直播 + 騰訊會議答疑 + 無限次回看
學習方式
- 在線直播
- 每天?1.5 小時，連續 6天
- 無限次回看視頻
- 通過微信群、騰訊會議終生答疑
配套資料
- 自編配套教材
- 一整套分析代碼和測試數據
課程安排
第一天
服務器硬件選購
- 硬件知識：服務器與個人電腦有什么區別？
- 硬件知識：CPU、內存、硬盤型號與參數
- 配置清單：1W - 2W元滿足工作、游戲、生物信息電腦配置（個人使用）
配置清單：5K - 2W元的高性價比配置（小團隊使用）
配置清單：2W - 50W的主流配置（小團隊使用）
- 配置清單：15W - 300W的集群配置（大團隊使用）
第二天
操作系統安裝
- 組建 raid 陣列，確保數據安全
- 安裝 Linux 操作系統
- 磁盤分區
- 磁盤配額：限制存儲、防止爆盤
- 網絡配置：設置固定IP
- 內網穿透：在家也可也訪問局域網服務器
- 域名解析：使用域名訪問服務器，再也不用記 IP 啦
- 遠程登錄：安裝 openssh-server
第三天
生物信息軟件安裝
- 目錄結構：公共軟件裝在哪？公共數據放哪里？
- 使用 apt/yum 安裝和管理基礎軟件
- 使用 conda 安裝和管理常用軟件
- 如何手動安裝軟件
- Perl：使用 cpanm 管理 Perl 模塊
- R：Rstudio Server 安裝？如何確保 Rstudio 環境與本地統一？
- Python：Python 模塊的安裝和管理
- 沒有 root 權限如何安裝軟件？
第四天
容器 使軟件開箱即用
- 理念：開箱即用，免去軟件安裝的麻煩
- docker：docker 的安裝和使用
- singularity：比 docker 更適合科研計算的容器
- 安裝：singularity 的安裝
- 封裝：使用 singularity 封裝基因組注釋流程
- 使用：使用 singularity 運行基因課的基因組注釋流程
第五天
管理 確保服務器安全穩定
- 網絡安全：防火墻與端口配置
- 用戶管理：用戶分組、創建和管理
- 任務監控：服務器負載監控、網絡流量監控和任務查殺
第六天
應用 服務器還有哪些玩法
- FTP服務：共享科研數據
- 私人網盤：再也不用百度網盤了
- 網站：60分鐘學會搭建實驗室網站
講師介紹
十年以上經驗生物信息工程師授課
基因課介紹
成立于 2017年7月，專注于生物信息學培訓。
基因課網校：已完成 30多 門視頻課程的開發，累計學員 17000余人。
線下培訓班：武漢、成都、西安、杭州、廣州、北京等地舉辦培訓班 30多 期。
主講老師 張旭東
曾任華大基因項目組組長、產品研發組組長。
2014年合伙創辦貝納基因，擔任CTO。
2017年創辦基因課，專注生物信息學培訓。發表文章：麻瘋樹基因組計劃（the plant journal）、鷹嘴豆基因組計劃（Nature Biotechnology）、 芝麻基因組計劃（Genome Biology）、獼猴桃群體研究（New Phytologist）。
助教老師 王瑩
曾任華大基因、貝納基因高級生物信息工程師。
擅長基因組拼接、比較基因組和進化分析。
發表文章：甲藻基因組（Science）、穿心蓮基因組（The Plant Journal）、野生大豆基因組（Nature Communications）、菊花基因組（Molecular Plant）、鷹嘴豆基因組計劃（Nature Biotechnology）、 芝麻基因組計劃（Genome Biology）、獼猴桃群體研究（New Phytologist）。
常見問題
1. 在哪里學習？
PC 端：www.sgautomtive.com 點視頻課；
微信端："基因課" 公眾號點視頻課；
有效期內可以無限次回放。
2. 如何互動答疑？
- 直播期間：學員可以通過文字提問
- 直播結束后：通過騰訊會議答疑，學員可以共享屏幕
3. 我是零基礎，能學會嗎？
本課程專為零基礎設計，內容相對簡單，而且課程周期長，配合互動答疑，只要肯花時間，跟上節奏，一定能學會的。
4. 電腦配置有什么要求？
沒有特別高的要求，平時使用還比較流暢就行。
5. 如何報名？
推薦直接線上購買，如需對公轉賬，請聯系我們。
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銀行對公轉賬
戶名：武漢簡并科技有限公司
開戶銀行：漢口銀行光谷分行
賬 號：005041000451905轉賬備注“單位-姓名”。
6. 關于合同、發票、培訓通知
- 通知：可提供培訓通知、會議通知
- 發票：可開培訓費、會議費、技術服務費、測序分析費等
- 合同：可提供合同、發票清單等
